دانشمندان هشدار می دهند ، ایالات متحده نسبت به نوع جدید ویروس آلوده نابینا است


یک مورد تأیید شده و یک مورد مشکوک به نوع جدید ویروس کرونا در دو نگهبان ملی که در خانه سالمندان Good Samaritan در سیملا ، کلرادو ، 30 دسامبر 2020 (متیو استاور / نیویورک تایمز) گمارده شده بودند ، پیدا شد.
یک مورد تأیید شده و یک مورد مشکوک به نوع جدید ویروس کرونا در دو نگهبان ملی که در خانه سالمندان Good Samaritan در سیملا ، کلرادو ، 30 دسامبر 2020 (متیو استوور / نیویورک تایمز) گمارده شده بودند ، پیدا شد.

از آنجا که هیچ سیستم قابل اعتمادی برای شناسایی تغییرات ژنتیکی در ویروس کرونا وجود ندارد ، کارشناسان هشدار می دهند که ایالات متحده برای ردیابی یک جهش خطرناک جدید بسیار مجهز است و کارکنان بهداشتی را برای تلاش برای مقابله با تهدید شدید نابینا می کند.

گزینه ای که هم اکنون در انگلیس در حال رشد است و بیمارستان ها را با موارد جدیدی روبرو می کند ، هم اکنون در ایالات متحده نادر است. اما ممکن است طی چند هفته آینده منفجر شود و فشار جدیدی را به بیمارستان های ایالات متحده وارد کند ، برخی از آنها در حال حاضر نزدیک به شکستن هستند.

ایالات متحده یک سیستم ملی مقیاس وسیع برای آزمایش ژنوم ویروس کرونا برای جهش های جدید ، از جمله آنهایی که توسط نوع جدید حمل می شود ، ندارد. هر هفته حدود 1.4 میلیون نفر از ویروس مثبت هستند ، اما محققان فقط تعیین توالی ژنوم را انجام می دهند – روشی که در نهایت می تواند نوع جدید را تشخیص دهد – در کمتر از 3000 نمونه از این هفته. و این کار توسط آزمایشگاه های مختلط دانشگاهی ، دولتی و تجاری انجام می شود.

برای خبرنامه صبح از نیویورک تایمز ثبت نام کنید

محققان می گویند که برنامه پایش ملی می تواند تعیین کند که گزینه جدید چقدر گسترده است و با افزایش یک دوره حیاتی که افراد آسیب پذیر در سراسر کشور می توانند واکسینه شوند ، به مقابله با نقاط در حال ظهور کمک کند. هزینه این کار چند صد میلیون دلار یا بیشتر خواهد بود. گرچه به نظر می رسد این یک قیمت شیب دار است ، اما این بخش کوچکی از خسارت اقتصادی 16 تریلیون دلاری است که انتظار می رود ایالات متحده به دلیل COVID-19 متحمل شود.

دکتر چارلز چیو ، محقق دانشگاه کالیفرنیا ، سانفرانسیسکو ، گفت: “ما به برخی راهنمایی ها نیاز داریم” ، تیم وی اولین موارد نسخه جدید در کالیفرنیا را مشاهده کرد. “این باید سیستمی باشد که در سطح ملی اعمال شود. بدون این نوع پشتیبانی ویژه ، به راحتی پایان نخواهد یافت. “

با استفاده از چنین سیستمی ، متخصصان بهداشت می توانند به مردم در مناطق آسیب دیده هشدار دهند و اقدامات جدیدی را برای مقابله با گزینه – مانند استفاده از ماسك بهتر ، ردیابی تماس ها ، تعطیلی مدارس یا محاصره موقت – و این كار را انجام دهند. در اوایل ، به جای انتظار برای هجوم جدید ، بیمارستان ها را با بیماران شایع کرده است.

دولت جدید بایدن ممکن است پذیرای این ایده باشد. TJ Ducklo ، سخنگوی انتقال گفت: “رئیس جمهور تازه انتخاب شده از یک برنامه آزمایشی ملی پشتیبانی می کند که می تواند به جلوگیری از گسترش COVID-19 و یافتن گزینه ها کمک کند.” “این به معنی آزمایش های بیشتر ، افزایش ظرفیت آزمایشگاه و سازگاری ژنوم است. این برای کنترل COVID-19 و آماده سازی ایالات متحده برای شناسایی و جلوگیری از تهدیدهای بیماری در آینده حیاتی است. “

کارشناسان از انگلیس به عنوان الگویی برای آنچه ایالات متحده می تواند انجام دهد ، یاد می کنند. محققان انگلیسی توالی ژنوم را تعیین کرده اند – یعنی. مواد ژنتیکی کامل در ویروس کرونا – از 10٪ نمونه های مثبت جدید. حتی اگر ایالات متحده فقط 1٪ از ژنوم های کشور یا حدود 2000 نمونه جدید در روز را توالی یابی کند ، نور جدیدی را برای نوع جدید و همچنین انواع دیگری که ممکن است ظهور کنند ، می تاباند.

اما اکنون ایالات متحده از رسیدن به این هدف فاصله دارد. طبق GISAID ، یک پایگاه داده بین المللی که محققان ژنوم ویروس کرونا را به اشتراک می گذارند ، در ماه گذشته ، محققان آمریکایی فقط چند صد ژنوم در روز توالی می دهند. و فقط چند کشور مسئول بیشتر تلاش ها هستند. در راس کالیفرنیا 8،896 ژنوم قرار دارد. در داکوتای شمالی که تاکنون بیش از 93 هزار و 500 مورد داشته است ، محققان حتی یک ژنوم را توالی یابی نکرده اند.

در ماه مارس ، انگلیس آنچه را که بسیاری از کارشناسان آمریکایی آرزو دارند آغاز کرد: یک برنامه ملی خوب برای ردیابی جهش ها در ویروس کرونا. این کشور 20 میلیون پوند – تقریباً 27 میلیون دلار – در راه اندازی كنسرسیومی علمی كه بیمارستان های سراسر كشور را منصوب می كند ، سرمایه گذاری می كند و روشهای استاندارد ارسال نمونه به آزمایشگاههای ویژه برای تعیین توالی ویروسهای آنها را در اختیار آنها قرار می دهد. با استفاده از رایانش ابری ، متخصصان جهش ها را تجزیه و تحلیل کردند و دریافتند که هر خط از ویروس درخت تکاملی در کجا قرار دارد.

اما هاچرافت ، اپیدمیولوژیست مولکولی در دانشگاه برن در سوئیس که به ایجاد Nextstrain ، یک پروژه ردیابی ویروس مستقر در سیاتل کمک کرد ، گفت: “آنچه انگلیس با تعیین توالی انجام داده است یک اقدام همه گیرانه برای من است.” “آنها تصمیم گرفتند توالی ها را انجام دهند ، و آنها فقط یک برنامه کاملاً شگفت انگیز را از ابتدا تنظیم کردند.”

برنامه فشرده انگلیس برای ردیابی تکامل ژنتیکی ویروس کرونا احتمالاً به همین دلیل است که ماه گذشته اولین کشوری بود که نوع جدیدی را با نام B117 شناسایی کرد. انگلیس تاکنون 209،038 ژنوم ویروس کرونا را توالی داده است – تقریباً دو سوم کل توالی یابی در جهان. ایالات متحده که 5 برابر کشور است ، فقط 58560 ژنوم را توالی داده است.

در ایالات متحده ، مجموعه ای از آزمایشگاه ها ، عمدتا دانشگاه ها ، ژنوم ویروس کرونا را در بهار تجزیه و تحلیل می کنند. بسیاری از آنها برای انجام کار هزینه های متوسط ​​خود را صرف می کنند. کریستین آندرسن ، متخصص ویروس در انستیتوی تحقیقات اسکریپس در سن دیگو ، که آزمایشگاه او در خط مقدم تلاش است ، گفت: “همه اینها به این جنبش های توده ای برمی گردد تا از زمین خارج شود.”

آندرسن و سایر دانشمندان مسیر ویروس کرونا را با گسترش در دنیا و ایالات متحده روشن می کنند. برخی از موارد اولیه در ایالات متحده از چین ، محل تولد ویروس کرونا ، نشات گرفته است ، اما مسافران از اروپا بیشتر موارد را به بسیاری از شهرهای آمریکا آورده اند.

اما پس از موفقیت اولیه ، غربالگری فقط در مقیاس کوچک ادامه یافت. آندرسن گفت: “قطعاً انقلابی در مشاهده ژنومی ایجاد نکرد.”

در ماه مه ، مراکز کنترل و پیشگیری از بیماری ده ها آزمایشگاه در ایالات متحده را در یک کنسرسیوم جمع کردند. به عنوان توالی سنجش واکنش اضطراری بهداشت عمومی SARS-CoV-2 ، کنسرسیوم اپیدمیولوژی و نظارت یا SPHERES شناخته می شود.

دانشمندان درگیر در SPHERES می گویند این شروع خوبی است. هودکروفت گفت: “شبکه ای واقعاً مفید برای دانشمندان ، دانشمندان و محققان فراهم شده است تا در ایالات متحده به یکدیگر کمک کنند.” آزمایشگاه هایی که می خواستند به تلاش برای تعیین توالی ژن ویروس کرونا بپردازند ، می توانند به جای کشف مجدد چرخ علم ، از آزمایشگاه های دیگر مشاوره بگیرند.

اما این یک برنامه ملی با اختیارات و منابع مشخص برای اطمینان از نظارت دقیق جهش ها در ایالات متحده نیست. آندرسن گفت: “ما به عنوان یک کشور ، به نظارت ژنومی نیاز داریم.” “این به یک حکم فدرال نیاز دارد.”

CDC حاضر نشد دانشمندانی را که SPHERES را اجرا می کنند برای مصاحبه در دسترس قرار دهد. برایان کاتزوویتس ، سخنگوی آژانس ، در بیانیه ای نوشت: “CDC با آزمایشگاه های بهداشت عمومی دولتی ، آزمایشگاه های دانشگاهی و تجاری در حال افزایش است تا توانایی نظارت بر سویه داخلی را برای سفارش هزاران نمونه در هر هفته افزایش دهد.”

روز چهارشنبه ، شرکت های تعیین توالی ژنتیک هلیکس و ایلومینا از همکاری برای ردیابی ظهور B117 با پشتیبانی CDC خبر دادند. رتبه بندی شرکت ها تا 1000 ژنوم در هفته است. اما سخنگوی ایلومینا ، کارن بیرمنگام سریعاً به این نکته اشاره کرد که برنامه آزمایشی بسیار دور از تلاش ملی است. وی گفت: “ما از مشاهده ژنومی به روش گسترده تر و هماهنگ تری در ایالات متحده استقبال می كنیم.”

سیستم قدرتمند نظارت ژنتیکی انگلیس به دانشمندان این امکان را داده است که درک کنند چقدر گزینه جدید خطرناک است. یک مطالعه هوشیارانه که روز دوشنبه توسط محققان کنسرسیوم تعیین توالی انگلیس منتشر شد ، نشان داد که محاصره این کشور در ماه نوامبر به خوبی در کاهش انتقال انواع رایج ویروس کرونا موثر بود ، اما مانع از گسترش B117 نشد.

محققان بهداشت عمومی شیوع ویروس را با چیزی به نام تعداد تولید مثل اندازه گیری می کنند. اگر تعداد تولید مثل 1 باشد ، به این معنی است که هر فرد آلوده آن را به طور متوسط ​​به شخص دیگری منتقل می کند. تعداد اپیدمی در حال افزایش بیش از 1 است ، در حالی که تعداد آن کمتر از 1 است. محققان انگلیسی تخمین می زنند ویروس های کرونا غیر از B117 در زمان انسداد ، تعداد باروری 0.95 دارند ، در حالی که تعداد تولید مثل B117 1.45 است .

سرعت رایج شدن B117 نشان می دهد که برخی از ویژگی های بیولوژیکی را دارد که باعث می شود از یک میزبان به میزبان دیگر منتقل شود. آزمایش های آزمایشگاهی نشان می دهد برخی از جهش های این ویروس باعث می شود تا ویروس با موفقیت بیشتری به سلول های مجاری هوایی متصل شود.

روز دوشنبه ، دولت انگلیس اعلام کرد که این کشور در حال ورود به محاصره ملی حتی سخت تر از ماه نوامبر است. دولت به شورا گفت: “شما نباید از خانه خارج شوید و یا از خانه دور باشید.”

خیلی زود است که بدانیم B117 چگونه بر بیماری همه گیر ایالات متحده تأثیر می گذارد – و اینکه آیا مانند بیمارستان های انگلیس تحت فشار قرار خواهد گرفت بسیار مهم است. بیشتر افرادی که آلوده می شوند ویروس را به دیگران منتقل نمی کنند. تعداد کمی از افراد مسئول بیشتر انتقال آن در رویدادهای موسوم به تخصیص بیش از حد هستند. آنها در نهایت در مکان مناسب و در زمان مناسب قرار می گیرند تا بطور همزمان افراد زیادی را آلوده کنند.

با این حال ، اگر گزینه جدید از همان مسیر حرکت در انگلیس پیروی کند ، در هفته های آینده سبقت گرفتن از گزینه های رایج و کمتر مسری را آغاز می کند. ناتان راف ، متخصص ویروس در دانشگاه ییل گفت: “این می تواند در طی چند ماه آینده به ویروس غالب تبدیل شود.”

اما یک چیز برای مطمعن شدن است. مأموران بهداشت عمومی نمی توانند گزینه را متوقف کنند ، مگر اینکه آن را ببینند. گروباو و سایر دانشمندان در حال ایجاد آزمایش های سفارشی برای B117 هستند که از واکنش زنجیره ای پلیمراز استفاده می کنند ، یک فناوری سریع و ارزان قیمت که می تواند برای آزمایش هر نوع ویروس کرونا مورد استفاده قرار گیرد.

اما گروبو گفت که اگر محققان مجبور نشوند برای ایجاد این آزمایشات مدتها پس از ورود یک نوع خطرناک جدید به ایالات متحده مبارزه کنند ، بسیار بهتر خواهد بود. وی گفت: “به طور كلی ، این فقط یك كمك باند است كه به دلیل عدم مشاهده ژنومی ما انجام می شود.”

یک برنامه ملی پایش ویروس کرونا نه تنها به محققان اجازه می دهد تا شیوع B117 را کنترل کنند ، بلکه جهش های جدید دیگر ، که احتمالاً حتی خطرناک تر هستند ، در جنس آن مشاهده می شود. انواع جدید حتی ممکن است در آلوده سازی سلولهای انسانی مثرتر باشند ، یا بدتر از آن ، ممکن است از واکسن یا داروهای ضد ویروسی اجتناب کنند.

هودکروفت گفت: “فقط این که ما آن را تنظیم نکرده ایم به این معنی نیست که نمی توانیم”. “ما فقط باید تصمیم بگیریم که این چیزی است که ما می خواهیم.”

وی تأکید کرد که تنها راه برای یافتن این اشکالات جدید خطرناک ، مراقبت از آنها است. “آنها روز اول حاضر می شوند و خود را معرفی می کنند و می گویند:” هی ، به من نگاه کن! ” “” او گفت: “کشف ما کمی طول می کشد و اگر نگاه نکنیم بیشتر طول می کشد.”

این مقاله در اصل در نیویورک تایمز منتشر شد.

© 2021 شرکت نیویورک تایمز


منبع: moshtagh-khabar.ir

دیدگاهتان را بنویسید

Comment
Name*
Mail*
Website*